进入二十一世纪后，随着信息数字化、网络化的发展，基于数字版权保护（DRM）的电子书在美国快速发展，有一本电子书曾创造了一天之内被下载400,000份的奇迹。国内互联网虽然也获得快速发展，但当时因缺乏数字版权的保护技术，网上电子书非常缺乏。

计算机所在2000年与方正集团联合开始研究面向电子书、电子报、电子杂志等平面出版物的DRM技术，研制成功了包括数字内容的安全性和完整性、可信计数机制、使用规则的描述和验证、权利转移、可信执行等一系列关键技术的DRM技术体系，在整体技术方面已经达到国际先进水平，在可信计数机制和DRM技术体系的完整性等方面居国际领先水平。

以DRM技术为核心，研制成功了具有DRM的电子书网络出版系统、电子公文交换系统、重要文档防扩散系统、原版原式电子报纸安全发行系统、数字报刊出版系统等产品，应用于出版社、图书馆、网络电子书店等，被400多家出版社采用，建立了3000多家数字图书馆，形成了三十多万种具有DRM的电子书，建立了包括电子书、电子报内容的“爱读爱看”中文数字内容阅读网站，推动了我国数字图书、数字报刊产业的发展。

数字版权保护技术因此在2003年被评为“信息产业重大技术发明”，其中的核心技术“一种手持设备文字排版对齐的方法”专利获2006年国家知识产权局第九届中国专利优秀奖，并入选2007年“首届全国杰出发明专利创新展”。